Thông tư liên tịch bao gồm có 4 chương, 22 điều. Trong đó:

Chương 1 gồm các quy định chung, từ Điều 1 đến Điều 3, quy định về phạm vi điều chỉnh, đối tượng áp dùng và nguyên tắc.

Chương 2 quy định về việc theo dõi tình hình phát triển của trẻ em Việt Nam được cho làm con nuôi nước ngoài, từ Điều 4 đến Điều 9, bao gồm quy định về việc thông báo tình hình phát triển của trẻ em; đôn đốc việc thông báo tình hình phát triển của trẻ em; tập hợp và lưu trữ báo cáo về tình hình phát triển của trẻ em; lập báo cáo đánh giá tình hình phát triển của trẻ em được cho làm con nuôi nước ngoài; cung cấp thông tin về tình hình phát triển của trẻ em; hỗ trợ con nuôi tìm hiểu thông tin về nguồn gốc.

Chương 3 quy định về bảo hộ trẻ em Việt Nam được cho làm con nuôi nước ngoài trong trường hợp cần thiết, từ Điều 10 đến Điều 15, quy định về việc thông báo Quyết định cho trẻ em Việt Nam làm con nuôi nước ngoài; các trường hợp cần bảo vệ trẻ em; tiếp nhận và xác minh thông tin, phản ánh tình trạng trẻ em cần được bảo vệ; thực hiện công tác bảo vệ trẻ em trong trường hợp cần thiết; giải quyết trường hợp trẻ em được cho làm con nuôi nước ngoài phải quay trở lại Việt Nam; tiếp nhận lại, bố trí việc chăm sóc, nuôi dưỡng trẻ em được cho làm con nuôi nước ngoài phải quay trở lại Việt Nam.

Chương 4 quy định về việc tổ chức thực hiện, từ Điều 16 đến Điều 22, quy định trách nhiệm của các cơ quan, tổ chức trong việc theo dõi tình hình phát triển của trẻ em Việt Nam được cho làm con nuôi nước ngoài và bảo hộ trẻ em trong trường hợp cần thiết; hiệu lực thi hành.
Việc ban hành Thông tư liên tịch số 03/2016/TTLT-BTP-BNG-BCA-BLĐTBXH  đáp ứng được yêu cầu thực tiễn đặt ra, bảo đảm công tác theo dõi tình hình phát triển của trẻ em được thực hiện một cách bài bản. Mặt khác, Thông tư liên tịch đã giúp nâng cao trách nhiệm của các Bộ, ngành và huy động được tối đa sự phối hợp giữa các cơ quan có thẩm quyền có liên quan trong công tác theo dõi tình hình phát triển của trẻ em Việt Nam được cho làm con nuôi nước ngoài và bảo hộ trẻ em trong trường hợp cần thiết. Ngoài ra, nội dung của Thông tư liên tịch cũng đảm bảo tính khả thi của Luật nuôi con nuôi và đảm bảo thi hành trách nhiệm quốc gia theo quy định tại điều 21 Công ước Lahay.

Với sự ra đời của Thông tư liên tịch số 03/2016/TTLT-BTP-BNG-BCA-BLĐTBXH, có thể khẳng định, hệ thống pháp luật về nuôi con nuôi của Việt Nam đã được hoàn thiện hơn và ngày càng phù hợp, đáp ứng yêu cầu chung của pháp luật quốc tế về nuôi con nuôi.